מאגר המידע של המכון ליזמות בחינוך כולל שני בסיסי נתונים:
1. עמותות פעילות בבתי ספר - המאגר נבנה מתוך שאלונים לבתי ספר ומפקחים, אתרי אינטרנט, רשימות רשם העמותות וגורמים נוספים, ורשומות בו כ-500 עמותות פעילות. המאגר כולל את שם עמותה, מטרתה כפי שהוצגה בפרסומי העמותה או אצל רשם העמותות, ופרטי התקשרות.
2. עמותות חינוך - מאגר זה נסמך בעיקר על נתוני רשם העמותות, והוא כולל יותר מ- 1,600 עמותות חינוך שנרשמו משנת 1981. עמותות אלו עוסקות במגוון נושאים חינוכיים, לאו דווקא בתוך בתי הספר. ביניהן עמותות הפונות לכלל הציבור, עמותות דתיות וחרדיות, ועמותות הפועלות בקרב הציבור הערבי.
המאגר מקוטלג לפי מערכת הקטלוג הנושאית של עמותות פעילות בבתי ספר. הנושאים העיקריים מבחינה מספרית הם נשירה, סובלנות, גני ילדים, דו-קיום, מדעים, שיטות לימוד, איכות סביבה, מורשת, דמוקרטיה, הפצת יהדות וצמצום פערים. המאגר כולל את שם עמותה, מטרתה ופרטי התקשרות.
נוסף על שני המאגרים העיקריים, פיתח המכון ליזמות מערכת קטלוג חדשה הכוללת את הקטגוריות הבאות:
קטלוג לפי קהלי יעד חברתיים
- ארגונים כלליים הפונים לכל הקהלים ללא הגבלה מבחינת נושא פעילותם והצהרתם.
- ארגונים דתיים הפונים לקהלים דתיים או עוסקים בנושאי דת.
- ארגונים ערביים המשרתים קהלים ערביים.
קטלוג לפי תחומים ראשיים
- ארגוני העשרה עוסקים בתחומי דעת הנלמדים בבתי ספר או נלמדו בעבר (לימודי ליבה- מתמטיקה, אנגלית, לשון ועוד), ותחומי דעת חדשים כגון מדעים, אמנויות ואיכות סביבה.
- ארגונים טיפוליים הם ארגונים מקצועיים שנותנים שירותי רווחה, פסיכולוגיה, אבחונים פדגוגיים או מטפלים בנושאים המשיקים לתחום הפדגוגי: נשירת תלמידים, טיפול בבעיות התמכרות, לקוויות למידה ועוד.
- ארגונים ערכיים שמטרתם להעביר מסר ערכי, אידיאולוגי, חברתי, דתי, וארגונים בעלי מסרים רוחניים חדשניים.
- ארגונים לצמצום פערים שמטרתם להתערב באזורים חלשים או בקרב תלמידים שבאים מרקע חברתי וכלכלי נמוך, כדי לחזק את התשתית החינוכית שלהם. חלק מהארגונים עוסקים בנושאי העשרה, אולם מטרתם העיקרית היא להביא לצמצום פערים.
- הכשרה ושיטות חינוך - ארגונים שעוסקים בשיטות חינוך ייחודיות, חדשניות, והכשרות מורים ייחודיות.
קטלוג נושאי
מערך הקטלוג הנושאי כולל עשרות נושאים, בהם יהדות, מדעים, צמצום פערים, מורשת, אמנויות במה, דמוקרטיה, שיטות חינוך, גישות ערכיות, אקולוגיה, ארגונים מקומיים ודו-קיום ערבי-יהודי.